郡山城は、筒井順慶が織田信長の後押しにより松永弾正久秀を破り、天正８(1580)年に信長から大和一国(20万石)を与えられた。そこで、順慶は居城を筒井城からこの地へ移したが、天正12(1584)年８月に死去してしまった。
その後、 大坂城を守る重要な場所だったので、秀吉の弟・秀長が100万石で郡山城へ入城。

秀吉没後の関ケ原の戦い後は、徳川譜代大名である水野勝成や松平忠明などが城主を務め、享保9(1724)年に柳沢吉里が甲府から入封後は柳沢氏が明治維新までこの地を居城としていた。

現在は本丸の石垣や天守台、堀が残っており、昭和55(1980)年に追手門、追手東隅櫓、追手向櫓が復元されている。